Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPI3

Lcor, Ligand-dependent corepressor, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorQ6ZPI3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LcorQ6ZPI3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms