Protein–RNA interactions for Protein: Q6W3F0

P4ha3, Prolyl 4-hydroxylase subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4ha3Q6W3F0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P4ha3Q6W3F0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms