Protein–RNA interactions for Protein: Q6VSS7

Rhox8, Reproductive homeobox 8, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox8Q6VSS7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Rhox8Q6VSS7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Rhox8Q6VSS7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
Rhox8Q6VSS7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Rhox8Q6VSS7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Rhox8Q6VSS7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Rhox8Q6VSS7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Rhox8Q6VSS7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Rhox8Q6VSS7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Rhox8Q6VSS7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Rhox8Q6VSS7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Rhox8Q6VSS7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Rhox8Q6VSS7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Rhox8Q6VSS7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Rhox8Q6VSS7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Rhox8Q6VSS7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Rhox8Q6VSS7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Rhox8Q6VSS7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms