Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFY1

Fchsd1, F-BAR and double SH3 domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd1Q6PFY1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fchsd1Q6PFY1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fchsd1Q6PFY1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fchsd1Q6PFY1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fchsd1Q6PFY1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fchsd1Q6PFY1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fchsd1Q6PFY1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fchsd1Q6PFY1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fchsd1Q6PFY1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Fchsd1Q6PFY1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fchsd1Q6PFY1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fchsd1Q6PFY1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fchsd1Q6PFY1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fchsd1Q6PFY1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fchsd1Q6PFY1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fchsd1Q6PFY1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fchsd1Q6PFY1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fchsd1Q6PFY1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fchsd1Q6PFY1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fchsd1Q6PFY1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fchsd1Q6PFY1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fchsd1Q6PFY1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fchsd1Q6PFY1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fchsd1Q6PFY1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fchsd1Q6PFY1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fchsd1Q6PFY1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fchsd1Q6PFY1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fchsd1Q6PFY1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fchsd1Q6PFY1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fchsd1Q6PFY1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fchsd1Q6PFY1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fchsd1Q6PFY1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fchsd1Q6PFY1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fchsd1Q6PFY1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fchsd1Q6PFY1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fchsd1Q6PFY1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fchsd1Q6PFY1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fchsd1Q6PFY1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fchsd1Q6PFY1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fchsd1Q6PFY1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fchsd1Q6PFY1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fchsd1Q6PFY1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fchsd1Q6PFY1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fchsd1Q6PFY1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Fchsd1Q6PFY1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Fchsd1Q6PFY1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Fchsd1Q6PFY1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fchsd1Q6PFY1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fchsd1Q6PFY1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fchsd1Q6PFY1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fchsd1Q6PFY1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fchsd1Q6PFY1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fchsd1Q6PFY1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fchsd1Q6PFY1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fchsd1Q6PFY1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fchsd1Q6PFY1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fchsd1Q6PFY1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fchsd1Q6PFY1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fchsd1Q6PFY1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Fchsd1Q6PFY1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fchsd1Q6PFY1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fchsd1Q6PFY1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fchsd1Q6PFY1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fchsd1Q6PFY1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fchsd1Q6PFY1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fchsd1Q6PFY1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fchsd1Q6PFY1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fchsd1Q6PFY1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fchsd1Q6PFY1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fchsd1Q6PFY1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fchsd1Q6PFY1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fchsd1Q6PFY1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fchsd1Q6PFY1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fchsd1Q6PFY1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fchsd1Q6PFY1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Fchsd1Q6PFY1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fchsd1Q6PFY1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fchsd1Q6PFY1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fchsd1Q6PFY1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fchsd1Q6PFY1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fchsd1Q6PFY1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fchsd1Q6PFY1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fchsd1Q6PFY1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fchsd1Q6PFY1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fchsd1Q6PFY1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fchsd1Q6PFY1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fchsd1Q6PFY1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fchsd1Q6PFY1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fchsd1Q6PFY1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fchsd1Q6PFY1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fchsd1Q6PFY1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fchsd1Q6PFY1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fchsd1Q6PFY1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fchsd1Q6PFY1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fchsd1Q6PFY1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fchsd1Q6PFY1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fchsd1Q6PFY1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fchsd1Q6PFY1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fchsd1Q6PFY1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fchsd1Q6PFY1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms