Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms