Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms