Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Trak1Q6PD31 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trak1Q6PD31 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trak1Q6PD31 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trak1Q6PD31 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trak1Q6PD31 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trak1Q6PD31 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trak1Q6PD31 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trak1Q6PD31 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trak1Q6PD31 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trak1Q6PD31 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trak1Q6PD31 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trak1Q6PD31 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trak1Q6PD31 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Trak1Q6PD31 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trak1Q6PD31 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trak1Q6PD31 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trak1Q6PD31 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trak1Q6PD31 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Trak1Q6PD31 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trak1Q6PD31 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Trak1Q6PD31 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trak1Q6PD31 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trak1Q6PD31 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trak1Q6PD31 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trak1Q6PD31 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trak1Q6PD31 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trak1Q6PD31 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trak1Q6PD31 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trak1Q6PD31 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Trak1Q6PD31 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trak1Q6PD31 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trak1Q6PD31 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trak1Q6PD31 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trak1Q6PD31 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trak1Q6PD31 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trak1Q6PD31 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trak1Q6PD31 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trak1Q6PD31 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trak1Q6PD31 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trak1Q6PD31 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trak1Q6PD31 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trak1Q6PD31 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trak1Q6PD31 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trak1Q6PD31 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trak1Q6PD31 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trak1Q6PD31 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trak1Q6PD31 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trak1Q6PD31 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trak1Q6PD31 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trak1Q6PD31 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trak1Q6PD31 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trak1Q6PD31 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trak1Q6PD31 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trak1Q6PD31 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trak1Q6PD31 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trak1Q6PD31 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trak1Q6PD31 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms