Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms