Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
Slx4Q6P1D7 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Slx4Q6P1D7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Slx4Q6P1D7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Slx4Q6P1D7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Slx4Q6P1D7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Slx4Q6P1D7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Slx4Q6P1D7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Slx4Q6P1D7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Slx4Q6P1D7 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Slx4Q6P1D7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Slx4Q6P1D7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Slx4Q6P1D7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Slx4Q6P1D7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Slx4Q6P1D7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Slx4Q6P1D7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Slx4Q6P1D7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Slx4Q6P1D7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Slx4Q6P1D7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Slx4Q6P1D7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Slx4Q6P1D7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Slx4Q6P1D7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Slx4Q6P1D7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Slx4Q6P1D7 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Slx4Q6P1D7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Slx4Q6P1D7 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Slx4Q6P1D7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Slx4Q6P1D7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Slx4Q6P1D7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Slx4Q6P1D7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Slx4Q6P1D7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Slx4Q6P1D7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Slx4Q6P1D7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Slx4Q6P1D7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Slx4Q6P1D7 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Slx4Q6P1D7 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Slx4Q6P1D7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Slx4Q6P1D7 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Slx4Q6P1D7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Slx4Q6P1D7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Slx4Q6P1D7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Slx4Q6P1D7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Slx4Q6P1D7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Slx4Q6P1D7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Slx4Q6P1D7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Slx4Q6P1D7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Slx4Q6P1D7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Slx4Q6P1D7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Slx4Q6P1D7 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Slx4Q6P1D7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Slx4Q6P1D7 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Slx4Q6P1D7 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Slx4Q6P1D7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Slx4Q6P1D7 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Slx4Q6P1D7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Slx4Q6P1D7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Slx4Q6P1D7 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Slx4Q6P1D7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Slx4Q6P1D7 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Slx4Q6P1D7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Slx4Q6P1D7 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Slx4Q6P1D7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Slx4Q6P1D7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Slx4Q6P1D7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Slx4Q6P1D7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slx4Q6P1D7 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slx4Q6P1D7 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Slx4Q6P1D7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slx4Q6P1D7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slx4Q6P1D7 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slx4Q6P1D7 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slx4Q6P1D7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Slx4Q6P1D7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Slx4Q6P1D7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Slx4Q6P1D7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Slx4Q6P1D7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Slx4Q6P1D7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Slx4Q6P1D7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Slx4Q6P1D7 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Slx4Q6P1D7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Slx4Q6P1D7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Slx4Q6P1D7 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Slx4Q6P1D7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Slx4Q6P1D7 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Slx4Q6P1D7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Slx4Q6P1D7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Slx4Q6P1D7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Slx4Q6P1D7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Slx4Q6P1D7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Slx4Q6P1D7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Slx4Q6P1D7 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Slx4Q6P1D7 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Slx4Q6P1D7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Slx4Q6P1D7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slx4Q6P1D7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slx4Q6P1D7 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slx4Q6P1D7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slx4Q6P1D7 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Slx4Q6P1D7 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slx4Q6P1D7 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms