Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms