Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fndc3bQ6NWW9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Fndc3bQ6NWW9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms