Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms