Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
SphkapQ6NSW3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SphkapQ6NSW3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SphkapQ6NSW3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SphkapQ6NSW3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SphkapQ6NSW3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SphkapQ6NSW3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SphkapQ6NSW3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SphkapQ6NSW3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SphkapQ6NSW3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SphkapQ6NSW3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms