Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ7

Ltv1, Protein LTV1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltv1Q6NSQ7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ltv1Q6NSQ7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms