Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms