Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt40Q6IFX3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
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