Protein–RNA interactions for Protein: Q6I6G8

Hecw2, E3 ubiquitin-protein ligase HECW2, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw2Q6I6G8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms