Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Carmil1Q6EDY6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Carmil1Q6EDY6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Carmil1Q6EDY6 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Carmil1Q6EDY6 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Carmil1Q6EDY6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Carmil1Q6EDY6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Carmil1Q6EDY6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Carmil1Q6EDY6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Carmil1Q6EDY6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Carmil1Q6EDY6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Carmil1Q6EDY6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Carmil1Q6EDY6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Carmil1Q6EDY6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Carmil1Q6EDY6 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Carmil1Q6EDY6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Carmil1Q6EDY6 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Carmil1Q6EDY6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Carmil1Q6EDY6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Carmil1Q6EDY6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms