Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
Smarca2Q6DIC0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Smarca2Q6DIC0 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Smarca2Q6DIC0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Smarca2Q6DIC0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Smarca2Q6DIC0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Smarca2Q6DIC0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Smarca2Q6DIC0 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Smarca2Q6DIC0 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Smarca2Q6DIC0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Smarca2Q6DIC0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Smarca2Q6DIC0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Smarca2Q6DIC0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Smarca2Q6DIC0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Smarca2Q6DIC0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Smarca2Q6DIC0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Smarca2Q6DIC0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Smarca2Q6DIC0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Smarca2Q6DIC0 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Smarca2Q6DIC0 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Smarca2Q6DIC0 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Smarca2Q6DIC0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Smarca2Q6DIC0 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Smarca2Q6DIC0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Smarca2Q6DIC0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Smarca2Q6DIC0 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Smarca2Q6DIC0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Smarca2Q6DIC0 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Smarca2Q6DIC0 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Smarca2Q6DIC0 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Smarca2Q6DIC0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Smarca2Q6DIC0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Smarca2Q6DIC0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Smarca2Q6DIC0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Smarca2Q6DIC0 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Smarca2Q6DIC0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Smarca2Q6DIC0 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Smarca2Q6DIC0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Smarca2Q6DIC0 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Smarca2Q6DIC0 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Smarca2Q6DIC0 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Smarca2Q6DIC0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Smarca2Q6DIC0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Smarca2Q6DIC0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Smarca2Q6DIC0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Smarca2Q6DIC0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Smarca2Q6DIC0 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Smarca2Q6DIC0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Smarca2Q6DIC0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Smarca2Q6DIC0 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Smarca2Q6DIC0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Smarca2Q6DIC0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Smarca2Q6DIC0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Smarca2Q6DIC0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Smarca2Q6DIC0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Smarca2Q6DIC0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Smarca2Q6DIC0 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Smarca2Q6DIC0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Smarca2Q6DIC0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Smarca2Q6DIC0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Smarca2Q6DIC0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Smarca2Q6DIC0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Smarca2Q6DIC0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Smarca2Q6DIC0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Smarca2Q6DIC0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Smarca2Q6DIC0 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Smarca2Q6DIC0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Smarca2Q6DIC0 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Smarca2Q6DIC0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Smarca2Q6DIC0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Smarca2Q6DIC0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Smarca2Q6DIC0 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Smarca2Q6DIC0 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Smarca2Q6DIC0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Smarca2Q6DIC0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Smarca2Q6DIC0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Smarca2Q6DIC0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Smarca2Q6DIC0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Smarca2Q6DIC0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Smarca2Q6DIC0 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Smarca2Q6DIC0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Smarca2Q6DIC0 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Smarca2Q6DIC0 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Smarca2Q6DIC0 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms