Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms