Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZU6

Thsd7a, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, mousemouse

Predictions only

Length 1,645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd7aQ69ZU6 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Thsd7aQ69ZU6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Thsd7aQ69ZU6 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Thsd7aQ69ZU6 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Thsd7aQ69ZU6 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Thsd7aQ69ZU6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Thsd7aQ69ZU6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Thsd7aQ69ZU6 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Thsd7aQ69ZU6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Thsd7aQ69ZU6 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Thsd7aQ69ZU6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Thsd7aQ69ZU6 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Thsd7aQ69ZU6 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Thsd7aQ69ZU6 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Thsd7aQ69ZU6 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Thsd7aQ69ZU6 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Thsd7aQ69ZU6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Thsd7aQ69ZU6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms