Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZL1

Fgd6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd6Q69ZL1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fgd6Q69ZL1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Fgd6Q69ZL1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fgd6Q69ZL1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fgd6Q69ZL1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fgd6Q69ZL1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fgd6Q69ZL1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fgd6Q69ZL1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fgd6Q69ZL1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Fgd6Q69ZL1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
Fgd6Q69ZL1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Fgd6Q69ZL1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fgd6Q69ZL1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fgd6Q69ZL1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fgd6Q69ZL1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fgd6Q69ZL1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Fgd6Q69ZL1 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fgd6Q69ZL1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fgd6Q69ZL1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fgd6Q69ZL1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fgd6Q69ZL1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fgd6Q69ZL1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fgd6Q69ZL1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fgd6Q69ZL1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fgd6Q69ZL1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fgd6Q69ZL1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fgd6Q69ZL1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fgd6Q69ZL1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fgd6Q69ZL1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fgd6Q69ZL1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Fgd6Q69ZL1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fgd6Q69ZL1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fgd6Q69ZL1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fgd6Q69ZL1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fgd6Q69ZL1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Fgd6Q69ZL1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fgd6Q69ZL1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fgd6Q69ZL1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fgd6Q69ZL1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fgd6Q69ZL1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fgd6Q69ZL1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fgd6Q69ZL1 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fgd6Q69ZL1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fgd6Q69ZL1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fgd6Q69ZL1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fgd6Q69ZL1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fgd6Q69ZL1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fgd6Q69ZL1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fgd6Q69ZL1 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Fgd6Q69ZL1 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Fgd6Q69ZL1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fgd6Q69ZL1 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fgd6Q69ZL1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fgd6Q69ZL1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fgd6Q69ZL1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fgd6Q69ZL1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Fgd6Q69ZL1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Fgd6Q69ZL1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Fgd6Q69ZL1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Fgd6Q69ZL1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Fgd6Q69ZL1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Fgd6Q69ZL1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Fgd6Q69ZL1 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Fgd6Q69ZL1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Fgd6Q69ZL1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Fgd6Q69ZL1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 287.8 ms