Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

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Length 2,350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Jmjd1cQ69ZK6 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Jmjd1cQ69ZK6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Jmjd1cQ69ZK6 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Jmjd1cQ69ZK6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Jmjd1cQ69ZK6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Jmjd1cQ69ZK6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Jmjd1cQ69ZK6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Jmjd1cQ69ZK6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Jmjd1cQ69ZK6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Jmjd1cQ69ZK6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Jmjd1cQ69ZK6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Jmjd1cQ69ZK6 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Jmjd1cQ69ZK6 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Jmjd1cQ69ZK6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Jmjd1cQ69ZK6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Jmjd1cQ69ZK6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Jmjd1cQ69ZK6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Jmjd1cQ69ZK6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Jmjd1cQ69ZK6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Jmjd1cQ69ZK6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Jmjd1cQ69ZK6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Jmjd1cQ69ZK6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Jmjd1cQ69ZK6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Jmjd1cQ69ZK6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Jmjd1cQ69ZK6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Jmjd1cQ69ZK6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Jmjd1cQ69ZK6 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Jmjd1cQ69ZK6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Jmjd1cQ69ZK6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Jmjd1cQ69ZK6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Jmjd1cQ69ZK6 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Jmjd1cQ69ZK6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Jmjd1cQ69ZK6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Jmjd1cQ69ZK6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Jmjd1cQ69ZK6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Jmjd1cQ69ZK6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Jmjd1cQ69ZK6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Jmjd1cQ69ZK6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Jmjd1cQ69ZK6 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Jmjd1cQ69ZK6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Jmjd1cQ69ZK6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Jmjd1cQ69ZK6 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Jmjd1cQ69ZK6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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