Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Irf4Q64287 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irf4Q64287 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Irf4Q64287 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irf4Q64287 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irf4Q64287 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irf4Q64287 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irf4Q64287 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irf4Q64287 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irf4Q64287 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irf4Q64287 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Irf4Q64287 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irf4Q64287 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irf4Q64287 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irf4Q64287 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irf4Q64287 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irf4Q64287 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irf4Q64287 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irf4Q64287 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irf4Q64287 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irf4Q64287 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms