Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Polr2kQ63871 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms