Protein–RNA interactions for Protein: Q62507

Coch, Cochlin, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CochQ62507 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CochQ62507 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CochQ62507 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CochQ62507 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CochQ62507 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CochQ62507 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CochQ62507 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CochQ62507 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CochQ62507 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CochQ62507 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CochQ62507 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CochQ62507 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CochQ62507 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CochQ62507 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CochQ62507 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CochQ62507 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CochQ62507 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CochQ62507 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CochQ62507 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CochQ62507 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CochQ62507 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CochQ62507 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CochQ62507 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CochQ62507 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CochQ62507 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CochQ62507 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CochQ62507 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CochQ62507 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CochQ62507 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CochQ62507 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CochQ62507 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CochQ62507 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CochQ62507 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CochQ62507 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CochQ62507 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CochQ62507 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CochQ62507 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CochQ62507 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CochQ62507 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CochQ62507 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CochQ62507 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CochQ62507 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CochQ62507 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CochQ62507 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CochQ62507 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CochQ62507 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CochQ62507 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CochQ62507 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CochQ62507 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CochQ62507 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CochQ62507 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CochQ62507 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CochQ62507 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CochQ62507 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CochQ62507 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CochQ62507 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CochQ62507 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CochQ62507 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CochQ62507 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CochQ62507 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CochQ62507 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CochQ62507 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CochQ62507 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CochQ62507 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CochQ62507 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CochQ62507 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CochQ62507 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CochQ62507 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CochQ62507 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CochQ62507 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CochQ62507 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CochQ62507 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CochQ62507 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CochQ62507 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CochQ62507 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CochQ62507 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CochQ62507 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CochQ62507 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CochQ62507 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CochQ62507 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CochQ62507 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CochQ62507 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CochQ62507 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CochQ62507 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CochQ62507 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CochQ62507 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CochQ62507 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CochQ62507 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CochQ62507 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CochQ62507 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CochQ62507 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CochQ62507 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CochQ62507 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CochQ62507 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CochQ62507 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CochQ62507 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CochQ62507 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CochQ62507 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CochQ62507 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CochQ62507 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms