Protein–RNA interactions for Protein: Q62395

Tff3, Trefoil factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff3Q62395 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms