Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AtmQ62388 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtmQ62388 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtmQ62388 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtmQ62388 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AtmQ62388 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AtmQ62388 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
AtmQ62388 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AtmQ62388 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AtmQ62388 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtmQ62388 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtmQ62388 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
AtmQ62388 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtmQ62388 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtmQ62388 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AtmQ62388 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms