Protein–RNA interactions for Protein: Q62383

Supt6h, Transcription elongation factor SPT6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt6hQ62383 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Supt6hQ62383 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Supt6hQ62383 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Supt6hQ62383 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Supt6hQ62383 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Supt6hQ62383 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Supt6hQ62383 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Supt6hQ62383 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Supt6hQ62383 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms