Protein–RNA interactions for Protein: Q62192

Cd180, CD180 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd180Q62192 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd180Q62192 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms