Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gli3Q61602 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms