Protein–RNA interactions for Protein: Q61025

Ift20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift20Q61025 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms