Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
JrkQ60976 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
JrkQ60976 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
JrkQ60976 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
JrkQ60976 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
JrkQ60976 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JrkQ60976 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
JrkQ60976 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
JrkQ60976 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms