Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbbp7Q60973 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms