Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf8Q60846 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfrsf8Q60846 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfrsf8Q60846 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfrsf8Q60846 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfrsf8Q60846 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfrsf8Q60846 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfrsf8Q60846 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf8Q60846 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf8Q60846 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf8Q60846 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf8Q60846 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf8Q60846 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf8Q60846 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf8Q60846 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf8Q60846 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf8Q60846 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf8Q60846 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf8Q60846 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf8Q60846 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf8Q60846 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf8Q60846 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf8Q60846 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf8Q60846 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf8Q60846 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf8Q60846 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf8Q60846 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf8Q60846 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf8Q60846 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf8Q60846 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf8Q60846 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf8Q60846 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf8Q60846 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf8Q60846 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf8Q60846 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf8Q60846 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf8Q60846 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf8Q60846 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf8Q60846 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf8Q60846 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf8Q60846 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf8Q60846 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf8Q60846 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf8Q60846 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf8Q60846 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf8Q60846 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf8Q60846 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf8Q60846 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf8Q60846 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf8Q60846 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf8Q60846 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf8Q60846 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf8Q60846 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf8Q60846 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf8Q60846 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf8Q60846 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf8Q60846 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf8Q60846 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf8Q60846 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf8Q60846 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf8Q60846 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms