Protein–RNA interactions for Protein: Q60769

Tnfaip3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip3Q60769 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfaip3Q60769 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfaip3Q60769 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfaip3Q60769 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfaip3Q60769 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfaip3Q60769 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfaip3Q60769 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfaip3Q60769 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfaip3Q60769 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfaip3Q60769 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfaip3Q60769 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfaip3Q60769 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfaip3Q60769 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfaip3Q60769 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfaip3Q60769 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfaip3Q60769 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfaip3Q60769 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfaip3Q60769 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfaip3Q60769 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfaip3Q60769 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfaip3Q60769 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfaip3Q60769 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfaip3Q60769 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfaip3Q60769 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfaip3Q60769 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfaip3Q60769 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfaip3Q60769 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfaip3Q60769 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfaip3Q60769 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfaip3Q60769 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfaip3Q60769 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfaip3Q60769 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfaip3Q60769 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfaip3Q60769 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfaip3Q60769 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfaip3Q60769 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfaip3Q60769 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfaip3Q60769 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tnfaip3Q60769 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfaip3Q60769 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfaip3Q60769 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfaip3Q60769 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tnfaip3Q60769 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfaip3Q60769 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfaip3Q60769 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfaip3Q60769 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfaip3Q60769 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfaip3Q60769 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfaip3Q60769 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfaip3Q60769 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfaip3Q60769 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfaip3Q60769 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfaip3Q60769 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfaip3Q60769 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfaip3Q60769 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfaip3Q60769 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfaip3Q60769 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfaip3Q60769 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfaip3Q60769 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfaip3Q60769 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfaip3Q60769 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfaip3Q60769 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfaip3Q60769 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfaip3Q60769 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfaip3Q60769 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfaip3Q60769 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms