Protein–RNA interactions for Protein: Q60767

Ly75, Lymphocyte antigen 75, mousemouse

Predictions only

Length 1,723 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly75Q60767 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ly75Q60767 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ly75Q60767 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ly75Q60767 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ly75Q60767 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ly75Q60767 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ly75Q60767 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ly75Q60767 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Ly75Q60767 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ly75Q60767 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ly75Q60767 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ly75Q60767 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ly75Q60767 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ly75Q60767 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ly75Q60767 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ly75Q60767 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ly75Q60767 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ly75Q60767 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ly75Q60767 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ly75Q60767 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ly75Q60767 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ly75Q60767 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ly75Q60767 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ly75Q60767 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ly75Q60767 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ly75Q60767 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ly75Q60767 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ly75Q60767 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ly75Q60767 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ly75Q60767 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ly75Q60767 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ly75Q60767 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ly75Q60767 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ly75Q60767 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ly75Q60767 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ly75Q60767 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ly75Q60767 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ly75Q60767 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ly75Q60767 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ly75Q60767 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ly75Q60767 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ly75Q60767 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ly75Q60767 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ly75Q60767 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ly75Q60767 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ly75Q60767 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ly75Q60767 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ly75Q60767 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ly75Q60767 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ly75Q60767 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ly75Q60767 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ly75Q60767 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ly75Q60767 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ly75Q60767 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ly75Q60767 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ly75Q60767 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ly75Q60767 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ly75Q60767 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ly75Q60767 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ly75Q60767 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ly75Q60767 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ly75Q60767 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ly75Q60767 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ly75Q60767 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ly75Q60767 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ly75Q60767 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ly75Q60767 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ly75Q60767 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ly75Q60767 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ly75Q60767 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ly75Q60767 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ly75Q60767 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ly75Q60767 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ly75Q60767 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ly75Q60767 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ly75Q60767 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ly75Q60767 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ly75Q60767 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ly75Q60767 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ly75Q60767 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ly75Q60767 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ly75Q60767 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ly75Q60767 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ly75Q60767 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ly75Q60767 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ly75Q60767 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ly75Q60767 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ly75Q60767 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ly75Q60767 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ly75Q60767 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ly75Q60767 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ly75Q60767 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ly75Q60767 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ly75Q60767 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ly75Q60767 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ly75Q60767 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ly75Q60767 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ly75Q60767 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ly75Q60767 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ly75Q60767 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms