Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mkrn3Q60764 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mkrn3Q60764 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mkrn3Q60764 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mkrn3Q60764 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mkrn3Q60764 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mkrn3Q60764 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mkrn3Q60764 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mkrn3Q60764 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mkrn3Q60764 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mkrn3Q60764 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mkrn3Q60764 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mkrn3Q60764 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mkrn3Q60764 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mkrn3Q60764 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Mkrn3Q60764 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mkrn3Q60764 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Mkrn3Q60764 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mkrn3Q60764 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mkrn3Q60764 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mkrn3Q60764 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mkrn3Q60764 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mkrn3Q60764 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mkrn3Q60764 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mkrn3Q60764 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Mkrn3Q60764 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mkrn3Q60764 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mkrn3Q60764 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mkrn3Q60764 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mkrn3Q60764 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mkrn3Q60764 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mkrn3Q60764 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mkrn3Q60764 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mkrn3Q60764 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mkrn3Q60764 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mkrn3Q60764 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mkrn3Q60764 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mkrn3Q60764 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mkrn3Q60764 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mkrn3Q60764 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mkrn3Q60764 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mkrn3Q60764 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mkrn3Q60764 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mkrn3Q60764 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mkrn3Q60764 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mkrn3Q60764 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Mkrn3Q60764 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Mkrn3Q60764 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Mkrn3Q60764 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mkrn3Q60764 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mkrn3Q60764 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mkrn3Q60764 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mkrn3Q60764 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mkrn3Q60764 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mkrn3Q60764 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mkrn3Q60764 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mkrn3Q60764 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mkrn3Q60764 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mkrn3Q60764 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mkrn3Q60764 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mkrn3Q60764 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mkrn3Q60764 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mkrn3Q60764 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mkrn3Q60764 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mkrn3Q60764 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mkrn3Q60764 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mkrn3Q60764 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Mkrn3Q60764 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mkrn3Q60764 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms