Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Samhd1Q60710 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms