Protein–RNA interactions for Protein: Q60670

Sik1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik1Q60670 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sik1Q60670 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sik1Q60670 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sik1Q60670 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sik1Q60670 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sik1Q60670 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sik1Q60670 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sik1Q60670 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sik1Q60670 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sik1Q60670 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sik1Q60670 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sik1Q60670 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sik1Q60670 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sik1Q60670 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sik1Q60670 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sik1Q60670 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sik1Q60670 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sik1Q60670 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sik1Q60670 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sik1Q60670 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sik1Q60670 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sik1Q60670 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sik1Q60670 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sik1Q60670 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sik1Q60670 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sik1Q60670 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sik1Q60670 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sik1Q60670 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sik1Q60670 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sik1Q60670 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sik1Q60670 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sik1Q60670 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sik1Q60670 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sik1Q60670 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sik1Q60670 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sik1Q60670 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sik1Q60670 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms