Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CttnQ60598 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CttnQ60598 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CttnQ60598 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CttnQ60598 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CttnQ60598 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CttnQ60598 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CttnQ60598 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CttnQ60598 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CttnQ60598 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CttnQ60598 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CttnQ60598 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CttnQ60598 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CttnQ60598 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CttnQ60598 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CttnQ60598 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms