Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms