Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms