Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms