Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Trim41Q5NCC3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Trim41Q5NCC3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Trim41Q5NCC3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Trim41Q5NCC3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Trim41Q5NCC3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Trim41Q5NCC3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Trim41Q5NCC3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Trim41Q5NCC3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Trim41Q5NCC3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Trim41Q5NCC3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Trim41Q5NCC3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Trim41Q5NCC3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Trim41Q5NCC3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Trim41Q5NCC3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Trim41Q5NCC3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Trim41Q5NCC3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Trim41Q5NCC3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Trim41Q5NCC3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Trim41Q5NCC3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Trim41Q5NCC3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Trim41Q5NCC3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Trim41Q5NCC3 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Trim41Q5NCC3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Trim41Q5NCC3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Trim41Q5NCC3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Trim41Q5NCC3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Trim41Q5NCC3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Trim41Q5NCC3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Trim41Q5NCC3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Trim41Q5NCC3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Trim41Q5NCC3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Trim41Q5NCC3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Trim41Q5NCC3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Trim41Q5NCC3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Trim41Q5NCC3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Trim41Q5NCC3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Trim41Q5NCC3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Trim41Q5NCC3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Trim41Q5NCC3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Trim41Q5NCC3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Trim41Q5NCC3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Trim41Q5NCC3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Trim41Q5NCC3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Trim41Q5NCC3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Trim41Q5NCC3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Trim41Q5NCC3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Trim41Q5NCC3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Trim41Q5NCC3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Trim41Q5NCC3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Trim41Q5NCC3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Trim41Q5NCC3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Trim41Q5NCC3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Trim41Q5NCC3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Trim41Q5NCC3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Trim41Q5NCC3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Trim41Q5NCC3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Trim41Q5NCC3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Trim41Q5NCC3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Trim41Q5NCC3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Trim41Q5NCC3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Trim41Q5NCC3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Trim41Q5NCC3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Trim41Q5NCC3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Trim41Q5NCC3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Trim41Q5NCC3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Trim41Q5NCC3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Trim41Q5NCC3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Trim41Q5NCC3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Trim41Q5NCC3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Trim41Q5NCC3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Trim41Q5NCC3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Trim41Q5NCC3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Trim41Q5NCC3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Trim41Q5NCC3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Trim41Q5NCC3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Trim41Q5NCC3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Trim41Q5NCC3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Trim41Q5NCC3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Trim41Q5NCC3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Trim41Q5NCC3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Trim41Q5NCC3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Trim41Q5NCC3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Trim41Q5NCC3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Trim41Q5NCC3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Trim41Q5NCC3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Trim41Q5NCC3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Trim41Q5NCC3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Trim41Q5NCC3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Trim41Q5NCC3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Trim41Q5NCC3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Trim41Q5NCC3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Trim41Q5NCC3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Trim41Q5NCC3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Trim41Q5NCC3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Trim41Q5NCC3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Trim41Q5NCC3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Trim41Q5NCC3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Trim41Q5NCC3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Trim41Q5NCC3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms