Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms