Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Nlrc3Q5DU56 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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Nlrc3Q5DU56 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Nlrc3Q5DU56 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Nlrc3Q5DU56 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Nlrc3Q5DU56 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nlrc3Q5DU56 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms