Protein–RNA interactions for Protein: Q569L8

Cenpj, Centromere protein J, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpjQ569L8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CenpjQ569L8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CenpjQ569L8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CenpjQ569L8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CenpjQ569L8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CenpjQ569L8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CenpjQ569L8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CenpjQ569L8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CenpjQ569L8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CenpjQ569L8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CenpjQ569L8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CenpjQ569L8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CenpjQ569L8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CenpjQ569L8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CenpjQ569L8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CenpjQ569L8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CenpjQ569L8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CenpjQ569L8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CenpjQ569L8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CenpjQ569L8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CenpjQ569L8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CenpjQ569L8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CenpjQ569L8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CenpjQ569L8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CenpjQ569L8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms