Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc84Q4VA36 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc84Q4VA36 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc84Q4VA36 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc84Q4VA36 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc84Q4VA36 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc84Q4VA36 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc84Q4VA36 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc84Q4VA36 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc84Q4VA36 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc84Q4VA36 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc84Q4VA36 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc84Q4VA36 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc84Q4VA36 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc84Q4VA36 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc84Q4VA36 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc84Q4VA36 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc84Q4VA36 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc84Q4VA36 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc84Q4VA36 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc84Q4VA36 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc84Q4VA36 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc84Q4VA36 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc84Q4VA36 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc84Q4VA36 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc84Q4VA36 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc84Q4VA36 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc84Q4VA36 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc84Q4VA36 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc84Q4VA36 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc84Q4VA36 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc84Q4VA36 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 304.1 ms