Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL18

Tmem171, Transmembrane protein 171, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem171Q4KL18 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem171Q4KL18 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem171Q4KL18 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem171Q4KL18 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem171Q4KL18 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem171Q4KL18 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem171Q4KL18 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem171Q4KL18 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem171Q4KL18 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem171Q4KL18 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem171Q4KL18 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem171Q4KL18 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem171Q4KL18 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem171Q4KL18 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem171Q4KL18 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem171Q4KL18 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem171Q4KL18 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem171Q4KL18 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem171Q4KL18 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem171Q4KL18 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem171Q4KL18 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem171Q4KL18 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem171Q4KL18 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem171Q4KL18 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem171Q4KL18 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem171Q4KL18 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem171Q4KL18 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem171Q4KL18 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem171Q4KL18 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem171Q4KL18 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem171Q4KL18 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem171Q4KL18 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem171Q4KL18 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem171Q4KL18 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem171Q4KL18 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem171Q4KL18 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem171Q4KL18 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem171Q4KL18 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem171Q4KL18 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem171Q4KL18 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem171Q4KL18 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem171Q4KL18 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem171Q4KL18 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem171Q4KL18 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem171Q4KL18 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem171Q4KL18 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem171Q4KL18 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem171Q4KL18 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem171Q4KL18 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem171Q4KL18 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem171Q4KL18 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem171Q4KL18 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem171Q4KL18 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem171Q4KL18 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem171Q4KL18 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem171Q4KL18 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem171Q4KL18 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms